%0 Journal Article %J Journal of Proteome Research %D 2018 %T ProForma: A Standard Proteoform Notation %A Leduc, R. D. %A Schwammle, V. %A Shortreed, M. R. %A Cesnik, A. J. %A Solntsev, S. K. %A Shaw, J. B. %A Martin, M. J. %A Vizcaino, J. A. %A Alpi, E. %A Danis, P. %A Kelleher, N. L. %A Smith, L. M. %A Ge, Y. %A Agar, J. N. %A Chamot-Rooke, J. %A Loo, J. A. %A Pasa-Tolic, L. %A Tsybin, Y. O. %B Journal of Proteome Research %V 17 %P 1321-1325 %8 Mar %@ 1535-3893 %G eng %R 10.1021/acs.jproteome.7b00851 %0 Journal Article %J Journal of Proteome Research %D 2018 %T Proteoform Suite: Software for Constructing, Quantifying, and Visualizing Proteoform Families %A Cesnik, A. J. %A Shortreed, M. R. %A Schaffer, L. V. %A Knoener, R. A. %A Frey, B. L. %A Scalf, M. %A Solntsev, S. K. %A Dai, Y. X. %A Gasch, A. P. %A Smith, L. M. %B Journal of Proteome Research %V 17 %P 568-578 %8 Jan %@ 1535-3893 %G eng %R 10.1021/acs.jproteome.7b00685 %0 Journal Article %J Bmc Genomics %D 2017 %T Proteomics in non-human primates: utilizing RNA-Seq data to improve protein identification by mass spectrometry in vervet monkeys %A Proffitt, J. M. %A Glenn, J. %A Cesnik, A. J. %A Jadhav, A. %A Shortreed, M. R. %A Smith, L. M. %A Kavanagh, K. %A Cox, L. A. %A Olivier, M. %B Bmc Genomics %V 18 %8 Nov %@ 1471-2164 %G eng %] 877 %R 10.1186/s12864-017-4279-0 %0 Book Section %D 2016 %T Proteogenomics: Integrating Next-Generation Sequencing and Mass Spectrometry to Characterize Human Proteomic Variation %A Sheynkman, G. M. %A Shortreed, M. R. %A Cesnik, A. J. %A Smith, L. M. %E Bohn, P. W. %E Pemberton, J. E. %S Annual Review of Analytical Chemistry %I Annual Reviews %C Palo Alto %V 9 %P 521-545 %@ 1936-1327
978-0-8243-4409-2 %G English %M WOS:000379328100023 %R 10.1146/annurev-anchem-071015-041722